Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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