Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSHL1Q14406 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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