Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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