Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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