Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME3Q13232 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms