Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2BQ13224 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms