Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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