Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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