Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME1Q06323 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms