Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2BQ02880 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP2BQ02880 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms