Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD1P98174 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD1P98174 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms