Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms