Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms