Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms