Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP98P52948 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP98P52948 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP98P52948 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP98P52948 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP98P52948 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms