Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THOP1P52888 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
THOP1P52888 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms