Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3AP49840 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms