Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms