Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RANGAP1P46060 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms