Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7BP35670 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms