Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms