Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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