Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR1P18146 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms