Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CCL3L1P16619 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCL3L1P16619 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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