Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB1P14653 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms