Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms