Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL13O43927 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms