Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1C5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1C5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1C5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1C5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1C5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1C5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1C5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms