Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms