Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT87PA6NCN2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms