Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms