Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A3GALT2U3KPV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms