Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETBP1Q9Y6X0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETBP1Q9Y6X0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETBP1Q9Y6X0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms