Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDC42BPBQ9Y5S2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDC42BPBQ9Y5S2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDC42BPBQ9Y5S2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDC42BPBQ9Y5S2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDC42BPBQ9Y5S2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDC42BPBQ9Y5S2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDC42BPBQ9Y5S2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms