Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms