Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3BQ9Y3B1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms