Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NINLQ9Y2I6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NINLQ9Y2I6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NINLQ9Y2I6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NINLQ9Y2I6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms