Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND2Q9UQB3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNND2Q9UQB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms