Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNH4Q9UQ05 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH4Q9UQ05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNH4Q9UQ05 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH4Q9UQ05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms