Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH3Q9ULD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH3Q9ULD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms