Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMFRQ9UKV5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMFRQ9UKV5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMFRQ9UKV5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms