Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRLS1Q9UJA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRLS1Q9UJA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRLS1Q9UJA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLS1Q9UJA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms