Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM10Q9UDY6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM10Q9UDY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM10Q9UDY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM10Q9UDY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms