Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC2Q9UBF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAGEC2Q9UBF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC2Q9UBF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms