Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MBD5Q9P267 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
MBD5Q9P267 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
MBD5Q9P267 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MBD5Q9P267 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms