Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNKQ9P0W0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNKQ9P0W0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNKQ9P0W0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNKQ9P0W0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNKQ9P0W0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNKQ9P0W0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNKQ9P0W0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms