Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4Q9P0V3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms