Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXXC1Q9P0U4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXXC1Q9P0U4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CXXC1Q9P0U4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXXC1Q9P0U4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms