Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP1Q9P0J1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDP1Q9P0J1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP1Q9P0J1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms