Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA13Q9P0J0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA13Q9P0J0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFA13Q9P0J0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms